Penyebab distrofi miotonik adalah mutasi genetik. Ini berarti, orangtua kandung dapat menurunkannya pada sang anak.Distrofi miotonik tipe 1 disebabkan oleh mutasi pada gen dystrophia myotonica protein kinase (DMPK). Sementara distrofi miotonik tipe 2 terjadi akibat mutasi pada gen cellular nucleic acid-binding protein (CNBP).