EB merupakan penyakit bawaan. Seseorang dapat mewarisi gangguan gen tertentu dari salah satu orangtua (autosomal dominan) atau kedua orang tua (autosomal resesif). Selain itu, kemunculan mutasi baru pada seseorang, bisa diwariskan pada generasi selanjutnya.Berbeda dari keempat tipe EB, Epidermolisis Bulosa Aquisita adalah satu-satunya jenis yang tidak diwariskan. Namun kondisi ini terjadi karena terdapat masalah dalam sistem kekebalan tubuh.
Satu-satunya cara yang mungkin dilakukan untuk mencegah EB dan penyakit genetik lainnya adalah dengan mengidentifikasi pembawa genetik dan memastikan bahwa setiap keturunan bebas dari cacat mutasi. Keluarga dengan riwayat penyakit mechanobullous (kerapuhan kulit yang luas) harus melakukan konseling untuk memastikan risiko EB lebih lanjut.